Veröffentlichungen

Datum der Überarbeitung: Oktober 2024

Vielen Dank an alle Familien, die an Simons Searchlight teilgenommen haben. Durch Ihr Engagement wollen wir Forschern und Genetikern weltweit helfen, genetische Störungen zu verstehen, die Sie oder Ihre Familie betreffen.

Die mit den Daten von Simons Searchlight durchgeführten Untersuchungen haben zu zahlreichen Veröffentlichungen geführt. Diese Arbeiten werden einem Peer-Review-Verfahren unterzogen, bei dem andere Wissenschaftler die Forschungsergebnisse bewerten und bestätigen, bevor sie in wissenschaftlichen Zeitschriften veröffentlicht werden. Darüber hinaus werden einige Ergebnisse über Preprints veröffentlicht, die eine schnelle Verbreitung der Informationen in der wissenschaftlichen Gemeinschaft ermöglichen.

Viele der Veröffentlichungen tragen den Namen “Simons Variation in Individuals Project” (SimonsVIP), was der ursprüngliche Name unseres Forschungsprogramms war, das jetzt als Simons Searchlight bekannt ist.

Die aufgelisteten Artikel sind chronologisch geordnet, vom ältesten bis zum neuesten. Sie können die Publikationen nach bestimmten genetischen Bedingungen durchsuchen, indem Sie die nachstehenden Kategorien verwenden.

Bis Oktober 2024 hat Simons Searchlight zu 108 Publikationen und Preprints beigetragen, und wir werden weiterhin neue Publikationen zusammenfassen.

Um die Zugänglichkeit zu gewährleisten, ermutigt die Simons Foundation Forscher, ihre Publikationen offen zugänglich zu machen. Wenn Sie keinen Zugang zu einem Zeitschriftenartikel haben, empfehlen wir Ihnen, sich an den letzten Autor zu wenden, der in dem Artikel aufgeführt ist, um eine Kopie zu erhalten.

Verstehen der Titel von Veröffentlichungen:

-Der Titel des Artikels wird gefolgt von den Angaben zur Veröffentlichung, einschließlich Ort und Datum der Veröffentlichung.
– Wenn es mehr als drei Autoren gibt, verwenden wir “et al.”, um weitere Mitwirkende darzustellen.
– Zeitschriften werden mit Kurzbezeichnungen referenziert.

Haftungsausschluss: Bitte beachten Sie, dass die auf medRxiv (sprich: med-archive) oder bioRxiv (sprich: bio-archive) veröffentlichten Artikel vor der Online-Veröffentlichung nicht von Fachkollegen geprüft oder bearbeitet werden. Im Gegensatz dazu wurden alle anderen hier aufgeführten Artikel von Forscherkollegen geprüft, um Qualität und Genauigkeit sicherzustellen. Während die Veröffentlichung auf medRxiv oder bioRxiv es den Forschern ermöglicht, ihre Ergebnisse schnell mitzuteilen, können die endgültigen veröffentlichten Ergebnisse nach der formalen Peer Review für die Veröffentlichung in einer Zeitschrift abweichen.

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91 Publications
Dysregulation der mTOR-Signalübertragung vermittelt gemeinsame Neuriten- und Migrationsdefekte in idiopathischen und 16p11.2-Deletionsautismus-Neuronenvorläuferzellen
  • Das Ziel dieser Untersuchung war es, herauszufinden, ob es Ähnlichkeiten in der Gehirnentwicklung zwischen Menschen mit Autismus, der eine genetische Ursache hat, und Menschen mit Autismus, für den keine genetische Ursache festgestellt wurde, gibt.Show More
  • Teilnehmer mit Autismus, für den keine genetische Ursache bekannt ist, wurden zu der Studie eingeladen. Die Studie umfasste auch Simons Searchlight-Teilnehmer mit einer 16p11.2-Deletion. Von allen Teilnehmern wurden biologische Proben entnommen. Auch von den Geschwistern der Teilnehmer, die nicht an Autismus erkrankt waren, wurden Proben genommen. Die Zellen der Teilnehmer wurden in Gehirnzellen umgewandelt, die im Labor untersucht werden konnten.
  • Die Forscher fanden heraus, dass die Labor-Gehirnzellen von Teilnehmern mit 16p11.2-Deletion anders wuchsen und sich anders bewegten als die Labor-Gehirnzellen ihrer Geschwister, die die Deletion nicht hatten. Die Zellen mit 16p11.2-Deletion waren den Zellen von Teilnehmern mit Autismus ohne genetische Ursache ähnlicher. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass Autismus möglicherweise nach einem gemeinsamen Entwicklungsprozess entsteht.
  • Die Forscher fanden jedoch einige Unterschiede zwischen den Zellen mit 16p11.2-Deletion und den Zellen von Teilnehmern mit Autismus, die keine genetische Ursache hatten. Sie vermuteten, dass die Unterschiede auf die Fähigkeit der Zellen zurückzuführen sein könnten, auf Kommunikationsfaktoren zu reagieren.
  • Die Forscher fanden heraus, dass eine strenge Kontrolle des Zellkommunikationsprozesses - nicht zu viel und nicht zu wenig - für die Gehirnentwicklung sehr wichtig ist.Show Less
bioRxiv Vorabdruck, (2024)
Prem et al.
Full Article

16p11.2 Deletie
2024

Diagnostische Präferenzen beinhalten eine Diskussion über die Ätiologie für Erwachsene mit zerebraler Lähmung und ihre Betreuer
  • Bei Kindern und Erwachsenen, bei denen eine Zerebralparese diagnostiziert wird, wird ein motorisches Problem festgestellt. Zerebralparese ist eine nicht-progressive Bewegungsstörung, und die Diagnose sagt nichts über die Ursache des Problems aus. Viele genetische Bedingungen können Probleme mit der Zerebralparese verursachen.Show More
  • Die Forscher erklärten, dass es unter den Ärzten eine gewisse Kontroverse darüber gibt, ob die Diagnose Zerebralparese gestellt werden soll, wenn die Krankheit auf einen genetischen Ursprung zurückzuführen ist. Dies ist anders als bei der Diagnose von Autismus oder Epilepsie, die ebenfalls medizinisch diagnostiziert werden und genetisch bedingt sein können.
  • Die Forscher befragten Menschen, bei denen eine zerebrale Lähmung diagnostiziert wurde, und ihre Betreuer, um ihre Gefühle zu dieser neurologischen Entwicklungsstörung zu verstehen.
  • Die Forscher schickten ihre Umfrage an Personen, die dem Cerebral Palsy Research Network und Simons Searchlight angehörten. Dazu gehören 16 Gruppen in Simons Searchlight: 16p11.2-Deletion, 1q21.1-Deletion, ADNP, ASXL3, CHAMP1, CSNK2A1, CTNNB1, DYRK1A, GRIN2B, HIVEP2, PPP2R1A, PPP2R5D, PCHD1, SCN2A, STXBP1 und SYNGAP1.
  • Es gab 197 Teilnehmer, und die Umfrage wurde zwischen Dezember 2019 und Mai 2020 verschickt.
  • Wichtig ist, dass bei den meisten Teilnehmern keine genetische Diagnose im Zusammenhang mit ihrer zerebralen Lähmung vorlag und dass die häufigste Ursache der zerebralen Lähmung in dieser Gruppe eine Hirnverletzung war. Nur die Hälfte der Teilnehmer an dieser Studie hat erfahren, woher ihre zerebrale Lähmung stammt.
  • Drei von vier Teilnehmern gaben an, dass es ihnen wichtig ist, die Ursache ihrer zerebralen Lähmung zu kennen. Viele Teilnehmer schätzten eine Zerebralparese-Diagnose mehr als eine genetische Diagnose, weil sie dadurch den Verlauf ihrer Symptome vorhersehen konnten, anderen ihre Symptome erklären konnten, Zugang zu Dienstleistungen erhielten und die Ursache ihrer Symptome verstehen konnten.
  • Die Forscher fanden heraus, dass Menschen mit zerebraler Kinderlähmung und ihre Betreuer insgesamt eine genetische Diagnose und eine Diagnose der zerebralen Kinderlähmung vorzogen.
  • Diese Forschung wurde durch einen Zuschuss der Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) unterstützt.Show Less
Dev Med Child Neurol 64, 723-733 (2022)
Aravamuthan et al.
Full Article

16p11.2 Deletie
1q21.1-Deletion
ADNP
ASXL3
CHAMP1
CSNK2A1
CTNNB1
DYRK1A
GRIN2B
HIVEP2
PCHD1
PPP2R1A
PPP2R5D
SCN2A
STXBP1
SYNGAP1
2022

Autismus-NPCs sowohl von idiopathischen als auch von CNV-Patienten mit 16p11.2-Deletion weisen eine Dysregulation der Proliferation und mitogenen Reaktionen auf
  • Bei der Mehrheit der Menschen mit einer Autismus-Diagnose ist eine genetische Ursache für ihren Autismus bekannt, auch idiopathischer Autismus genannt. Nur etwa 1 von 5 Menschen erhalten eine genetische Diagnose im Zusammenhang mit ihrem Autismus. Show More
  • Das Ziel dieser Forschung war es, zu verstehen, warum manche Menschen mit idiopathischem Autismus einen überdurchschnittlich großen Kopf entwickeln und andere nicht. Zu diesem Zweck verwendeten die Forscher induzierte pluripotente Stammzellen (iPSCs) von Teilnehmern mit einer 16p11.2-Deletion, da Menschen mit dieser Deletion dazu neigen, einen überdurchschnittlich großen Kopf zu haben. iPSCs sind eine spezielle Art von Zellen, die in andere Körperzellen umgewandelt werden können. Dies erleichtert die Untersuchung von schwer zu untersuchenden Körperteilen, wie z.B. Gehirnzellen.
  • Zwei der iPSCs, die von Simons Searchlight-Teilnehmern mit einer 16p11.2-Deletion stammen, wurden im Labor in Gehirnzellen verwandelt. Die Forscher untersuchten auch iPSCs von drei Familien, die an der New Jersey Language and Autism Genetics Study teilnahmen, sowie von zwei Menschen ohne Autismus von den National Institutes of Health (NIH).
  • Dieses Papier fasst die klinischen und intellektuellen Informationen über die Teilnehmer zusammen.
  • Bei allen Teilnehmern mit idiopathischem Autismus gab es Probleme mit der Kontrolle des Zellwachstums. Bei zwei Teilnehmern nahm die Zahl der Zellen, die wachsen konnten, ab, und bei einem Teilnehmer kam es zu einem übermäßigen Wachstum der Zellen. Alle Teilnehmer mit einer 16p11.2-Deletion hatten ein erhöhtes Zellwachstum.
  • Die Forscher testeten alle Zellen, um zu sehen, ob es ähnliche genetische Wege gibt, die die Probleme beim Zellwachstum verursachen. Sie fanden heraus, dass die Zellen von Teilnehmern mit idiopathischem Autismus unterschiedliche Muster von genetischen Markern aufwiesen. Die Zellen von Teilnehmern mit einer 16p11.2-Deletion wiesen einige ähnliche genetische Muster auf.
  • Die Forscher vermuten, dass ein Zuviel oder Zuwenig an neurologischen Entwicklungsmechanismen zur Entstehung von Autismus beiträgt.Show Less
Stammzellenvertreter 17, 1380-1394 (2022)
Connacher et al.
Full Article

16p11.2 Deletie
2022

Konsistenz der von den Eltern gemeldeten SLC6A1-Daten in Simons Searchlight mit den Veröffentlichungen der Anbieter
  • Um die Aussagekraft der von den Eltern gemeldeten Daten in Simons Searchlight zu untersuchen, verglichen die Forscher die medizinischen Merkmale von Personen mit genetischen SLC6A1-Varianten, wie sie von den Eltern gemeldet wurden, mit denen, die in medizinischen Veröffentlichungen stehen.Show More
  • Es kann schwierig sein, die Patienten einer weltweiten Gemeinschaft seltener Krankheiten von denselben Ärzten untersuchen zu lassen. Simons Searchlight bietet den Forschern eine einzigartige Gelegenheit, die Gemeinschaft online zu untersuchen, und ermöglicht auch mehr Menschen die Teilnahme.
  • Die Forscher verglichen 116 Personen mit SLC6A1-Genvarianten, die in medizinischen Veröffentlichungen beschrieben wurden, mit 43 Personen in Simons Searchlight.
  • Beim Vergleich der von den Eltern gemeldeten Daten mit den von den Anbietern gemeldeten Informationen gab es die wenigsten fehlenden Datenpunkte für Krankheiten wie Epilepsie und Autismus. In den vom Anbieter gemeldeten Daten fehlten einige klinische Merkmale, die die Eltern gefunden hatten.
  • Die Forscher fanden keinen Unterschied in der Häufigkeit von Entwicklungsverzögerung, Autismus und Aufmerksamkeitsdefizit-Hyperaktivitätsstörung zwischen den beiden Gruppen. Sie stellten jedoch fest, dass die Eltern etwas häufiger über einen niedrigen Muskeltonus und Bewegungsprobleme berichteten als Personen, die von einem Arzt untersucht wurden. Bei Personen, die von Ärzten aufgesucht wurden, war die Wahrscheinlichkeit höher, dass sie als epilepsiekrank beschrieben wurden, aber der Unterschied war nicht groß.Show Less
J Neurodev Disord 14, 40 (2022)
Bain et al.
Full Article

SLC6A1
2022

Kurzbericht: Unterschiede in der naturalistischen Aufmerksamkeit auf reale Szenen bei Jugendlichen mit 16p.11.2-Deletion
  • Das Ziel dieser Forschung war es, die spezifischen klinischen Manifestationen bei Menschen mit einer 16p11.2-Deletion zu untersuchen.Show More
  • Menschen mit einer 16p11.2-Deletion weisen eine erhöhte Rate an Autismus und autismusbezogenen Merkmalen auf.
  • Die Forscher führten Eye-Tracking-Studien an 21 jugendlichen und erwachsenen Teilnehmern mit einer 16p11.2-Deletion und 23 Teilnehmern ohne genetische Vorbelastung durch. Teilnehmer mit einer 16p11.2-Deletion wurden von Simons Searchlight rekrutiert.
  • Die Forscher verwendeten ein Virtual-Reality-Headset, um den Teilnehmern reale Szenen mit Objekten, Personen oder Hintergrundkulissen zu zeigen. Die Forscher erstellten Eye-Tracking-Karten auf der Grundlage dessen, worauf sich die Teilnehmer konzentrierten.
  • Die Forscher fanden heraus, dass Geschlecht, IQ und autistische Züge keine guten Prädiktoren dafür waren, worauf sich die Teilnehmer konzentrierten. Teilnehmer mit einer 16p11.2-Deletion hatten weniger Beobachtungen in jeder Szene und weniger Fixierungen. Die Forscher schlugen vor, jüngere Teilnehmer mit einer 16p11.2-Deletion zu untersuchen, um zu sehen, ob sich ein deutlicheres Muster ergibt.Show Less
J Autism Dev Disord Epub ahead of print, (2024)
Haskins et al.
Full Article

16p11.2 Deletie
2024

Kontrastives maschinelles Lernen enthüllt die Struktur der neuroanatomischen Variation bei Autismus
  • Die Forscher nutzten die Bildgebung des Gehirns und eine Computersoftware, um die Muster der Gehirnstruktur bei Menschen mit Autismus zu identifizieren. Sie nutzten den Autism Brain Imaging Data Exchange I (ABIDE I) Magnetresonanztomographie-Datensatz (MRT) von 470 Menschen mit Autismus, um die wichtigsten bildgebenden Theorien zu erstellen. Sie verglichen die Bilder von Menschen mit Autismus mit 512 Bildern von Menschen ohne Autismus.Show More
  • Dann verwendeten die Forscher 121 Bilder aus den Simons Searchlight 16p11.2-Daten, um zu überprüfen, was sie gefunden hatten, und um zu sehen, ob sie Menschen mit einer Autismus-Diagnose identifizieren können.
  • Die Forscher stellten fest, dass es Unterschiede in den Gehirnstrukturen der Menschen gibt und dass einige Teile des Gehirns schwerer abzubilden sind als andere. Sie fanden heraus, dass autismusspezifische Gehirnstrukturen in verschiedenen Altersstufen unterschiedlich sind, so dass Vergleiche innerhalb von Altersgruppen und nicht zwischen verschiedenen Altersstufen vorgenommen werden sollten. Sie wiesen auch darauf hin, dass es aufgrund der großen Unterschiede zwischen den Gehirnen schwer zu sagen ist, welche Unterschiede auf normale Gehirnvariationen und welche auf Autismus zurückzuführen sind. Daher sollten dieselben Gehirne im Laufe der Zeit untersucht werden, um zu erfahren, wie sie sich entwickeln.
  • Ihr Computermodell war in der Lage, individuelle, für Autismus spezifische Hirnstrukturmuster zu identifizieren und sie mit den klinischen Merkmalen eines Teilnehmers in Verbindung zu bringen, z. B. mit repetitiven Verhaltensweisen und adaptivem Verhalten. Die Forscher verwendeten Simons Searchlight-Daten, um die Ergebnisse ihrer ABIDE I-Daten zu bestätigen.
  • Diese Forschung wurde durch einen Zuschuss der Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) unterstützt.Show Less
Wissenschaft 376, 1070-1074 (2022)
Aglinskas et al.
Full Article

16p11.2 Deletie
16p11.2-Duplikat
2022

Klinische, neurobildgebende und molekulare Merkmale von PPP2R5D-bedingten neurologischen Entwicklungsstörungen: Eine erweiterte Serie mit funktioneller Charakterisierung und Genotyp-Phänotyp-Analyse
  • Dies ist die erste Veröffentlichung zu PPP2R5D, die sich auf Simons Searchlight-Daten konzentriert.Show More
  • PPP2R5D steht für protein phosphatase 2 regulatory subunit B delta. In den Zellen ist PPP2R5D ein Enzym, das den Aminosäuren Serin und Threonin ein so genanntes Phosphatmolekül hinzufügt.
  • Diese Studie umfasst 72 Simons Searchlight-Teilnehmer mit einer pathogenen oder wahrscheinlich pathogenen genetischen Variante in PPP2R5D. Damit kommen zu den 31 Personen mit PPP2R5D-Genvarianten, die bisher in der medizinischen Fachliteratur veröffentlicht wurden, weitere hinzu.
  • Die Forscher untersuchten die genetischen Varianten der Funktion von PPP2R5D und teilten die Varianten in drei verschiedene Kategorien ein.
  • Das Alter der Teilnehmer reichte von 1 bis 45 Jahren. Die meisten Teilnehmer hatten einen geringen Muskeltonus und einen überdurchschnittlich großen Kopf. Etwa die Hälfte der Teilnehmer hatte Anfälle, wobei das Durchschnittsalter beim Auftreten der Anfälle bei etwas über 2 Jahren lag. Die Anfallsaktivität variierte von Teilnehmer zu Teilnehmer: Einige hatten mehr als 100 Anfälle pro Tag, andere nur einen pro Jahr.
  • Die Teilnehmer hatten die größten Schwierigkeiten mit der expressiven Kommunikation und den persönlichen Fähigkeiten im täglichen Leben. Etwa 1 von 3 Teilnehmern litt unter saurem Reflux und Verstopfung.
  • Die Forscher fanden heraus, dass etwa 1 von 5 Teilnehmern eine Entwicklungsverzögerung oder geistige Behinderung aufwies, was weniger ist als in anderen Studien berichtet wurde.
  • Die Forscher untersuchten, ob es einen Zusammenhang zwischen genetischen Varianten und medizinischen Merkmalen gibt. Die meisten Personen mit Glu198Lys und Trp207Arg wiesen die einheitlichsten medizinischen Merkmale auf; beide Varianten gehören zur gleichen Funktionskategorie.
  • Dies war die bisher größte Studie mit Teilnehmern mit einer PPP2R5D-Genvariante. Zum ersten Mal konnten die Forscher in großem Maßstab die Funktion untersuchen, die genetische Varianten in der Zelle in Bezug auf klinische Merkmale haben.Show Less
J Med Genet Epub ahead of print, (2022)
Oyama et al.
Full Article

PPP2R5D
2022