Publicaties

Herziene datum: Oktober 2024

Bedankt aan alle gezinnen voor hun deelname aan Simons Zoeklicht. Door jouw betrokkenheid willen we onderzoekers en genetici wereldwijd helpen bij het begrijpen van genetische aandoeningen die van invloed zijn op jou of je familie.

Het onderzoek dat is uitgevoerd met de gegevens van Simons Searchlight heeft geresulteerd in een groot aantal gepubliceerde artikelen. Deze papers ondergaan een peer-review proces, waarbij andere wetenschappers het onderzoek beoordelen en valideren voor publicatie in wetenschappelijke tijdschriften. Bovendien worden sommige bevindingen gedeeld via preprints, waardoor informatie snel kan worden verspreid onder de wetenschappelijke gemeenschap.

Veel van de publicaties dragen de naam “Simons Variation in Individuals Project” (SimonsVIP), wat de oorspronkelijke naam was van ons onderzoeksprogramma, dat nu bekend staat als Simons Searchlight.

De artikelen zijn chronologisch gerangschikt, van oud naar nieuw. Je kunt publicaties per specifieke genetische aandoening bekijken met behulp van de onderstaande categorieën.

Vanaf oktober 2024 heeft Simons Searchlight bijgedragen aan 108 publicaties en preprints, en we zullen nieuwe publicaties blijven samenvatten.

Voor de toegankelijkheid moedigt de Simons Foundation onderzoekers aan om hun publicaties open access te maken. Als je geen toegang kunt krijgen tot een tijdschriftartikel, raden we je aan contact op te nemen met de laatste auteur die op het artikel vermeld staat om een kopie aan te vragen.

Publicatieverwijzingstitels begrijpen:

-De titel van het artikel wordt gevolgd door publicatiegegevens, waaronder waar en wanneer het artikel is gepubliceerd.
– Als er meer dan drie auteurs zijn, gebruiken we “et al.” voor extra medewerkers.
– Tijdschriften worden aangeduid met steno-namen.

Disclaimer: Houd er rekening mee dat artikelen die op medRxiv (uitgesproken als med-archive) of bioRxiv (uitgesproken als bio-archive) worden geplaatst, niet door vakgenoten worden beoordeeld of geredigeerd voordat ze online worden gepubliceerd. Alle andere artikelen die hier worden genoemd, zijn daarentegen beoordeeld door collega-onderzoekers om de kwaliteit en nauwkeurigheid te garanderen. Hoewel het publiceren op medRxiv of bioRxiv onderzoekers in staat stelt om hun bevindingen snel te delen, kunnen de uiteindelijke gepubliceerde resultaten verschillen nadat ze formele peer review hebben ondergaan voor publicatie in een tijdschrift.

Show More
Show Less

Search

  • Filter
  • Clear All
Genetic Condition
Year of Publication
90 Publications
Overexpressie van CD47 is geassocieerd met overgroei van de hersenen en het 16p11.2 deletiesyndroom
  • Mensen met een 16p11.2 deletie hebben vaak een groot hoofd en op MRI's is te zien dat ze een vergroting van het hersenstofvolume hebben.Show More
  • De onderzoekers kregen geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC's) van Simons Searchlight om te bestuderen waarom de hersenmassa groter is bij mensen met een 16p11.2 deletie.
  • iPSC's zijn een speciaal soort cellen die in andere lichaamscellen kunnen worden veranderd, waardoor het makkelijker wordt om delen van het lichaam te bestuderen die moeilijk te bestuderen zijn, zoals hersencellen.
  • De onderzoekers kregen iPSC's van zes mensen met een 16p11.2 deletie, twee mensen met een 16p11.2 duplicatie en drie mensen zonder genetische verandering. Ze kregen ook medische gegevens van de mensen die de cellen doneerden van Simons Searchlight. Vier van de zes mensen met een 16p11.2 deletie hadden een veel groter hoofd dan de gemiddelde populatie.
  • De onderzoekers veranderden de iPSC's in hersencellen en bestudeerden veranderingen in genexpressie en celcommunicatie. Ze ontdekten dat de cellen met een 16p11.2 deletie een toename hadden van een celsignaal met de naam CD47. CD47 staat voor cluster van differentiatie 47 en werkt als een 'eet me niet'-signaal voor het immuunsysteem.
  • De onderzoekers toonden aan dat immuuncellen minder geneigd waren om de 16p11.2 deletiecellen op te eten dan de 16p11.2 duplicatiecellen of gewone hersencellen. In soortgelijke studies bij muizen toonden de onderzoekers aan dat hersencellen met extra CD47 minder snel werden opgegeten door immuuncellen.
  • De onderzoekers suggereerden dat de groei en vergroting van de hersenen bij mensen met een 16p11.2 deletie te wijten zou kunnen zijn aan celcommunicatiefactoren.Show Less
Proc. Natl Acad Sci VS 118, e2005483118 (2021)
Li et al.
Full Article

16p11.2 deletie
2021

Neurologische ontwikkelingsfenotypes bij personen met pathogene varianten in CHAMP1
  • Dit is de eerste publicatie over CHAMP1 met Simons Searchlight-gegevens.Show More
  • CHAMP1 staat voor chromosome alignment maintaining phosphoprotein 1 en is belangrijk voor celherstel.
  • Dit onderzoek omvatte 14 mensen met een CHAMP1 genetische variant die als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen werd bestempeld.
  • Twaalf van deze mensen staan geregistreerd in Simons Zoeklicht.
  • Inclusief dit artikel zijn er tot nu toe 32 mensen met een CHAMP1 genetische aandoening gevonden.
  • Veel voorkomende medische aandoeningen bij mensen met een CHAMP1 genetische aandoening zijn: verstandelijke beperking, ontwikkelingsachterstand, taalproblemen, kleiner dan gemiddelde hoofdomtrek, gedragsproblemen waaronder autisme, toevallen, lage spierspanning, maag-darmproblemen (reflux en constipatie) en oogproblemen.
  • De twee meest effectieve anti-epileptica voor deze groep waren divalproex-natrium en levetiracetam.
  • Belangrijk is dat er bij geen enkel individu sprake was van ontwikkelingsregressie.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Cold Spring haven Mol zaak Stud 7, a006092 (2021)
Garrity et al.
Full Article

CHAMP1
2021

16pdel lipidenveranderingen in iPSC-afgeleide neuronen en de functie van FAM57B in lipidenmetabolisme en synaptogenese
  • Deze onderzoekers bestudeerden de rol van het FAM57B-gen in de ontwikkeling van de hersenen. FAM57B staat voor family with sequence similarity 57, member B, en bevindt zich bij mensen in de 16p11.2 regio. Er zijn ongeveer 29 genen in de 16p11.2 regio. Wanneer iemand een 16p11.2 deletie heeft, ontbreekt er één kopie van dit gen. Show More
  • De onderzoekers gebruikten geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC's) van Simons Searchlight deelnemers met een 16p11.2 deletie. De onderzoekers veranderden deze iPSC's in verschillende soorten hersencellen.
  • De onderzoekers bestudeerden vetten in de hersenen omdat FAM57B belangrijk zou zijn voor het aanmaken van bepaalde microscopische vetten in de hersenen. Menselijke hersenen bestaan voornamelijk uit verschillende soorten vetten.
  • In de in het lab gemaakte hersencellen met een 16p11.2 deletie waren er abnormale niveaus van veel vetten en de onderzoekers suggereerden dat dit kwam doordat er minder FAM57B in deze cellen was.
  • De onderzoekers gebruikten CRISPR/Cas9 om het FAM57B gen te verwijderen uit een set cellen die niet de 16p11.2 deletie hadden. Hierdoor konden de onderzoekers zien wat er gebeurt met het vetgehalte als alleen het FAM57B-gen wordt verwijderd. De onderzoekers vonden abnormale niveaus van vetten in de CRISPR/Cas9 cellen, vergelijkbaar met wat ze zagen in de 16p11.2 deletie cellen van deelnemers. De onderzoekers deden ook onderzoek met vismodellen en vonden vergelijkbare resultaten.
  • De onderzoekers suggereerden dat de kenmerken die ze vonden in de in het lab gemaakte hersencellen waarbij alleen het FAM57B gen verwijderd was, niet de volledige 16p11.2 deletie conditie verklaren en dat er andere genen in de 16p11.2 regio zijn die belangrijk zijn voor de hersenfunctie.Show Less
iScience 25, 103551 (2021)
Tomasello et al.
Full Article

16p11.2 deletie
2021

Een genetica-eerste benadering voor het ontleden van de heterogeniteit van autisme: Fenotypische vergelijking van autisme risico kopiegetal varianten
  • Om het autismeprofiel van mensen met een 16p11.2 of 22q11.2 deletie of duplicatie te begrijpen, bestudeerden onderzoekers de kenmerken van autisme bij deze personen.Show More
  • Aan dit onderzoek namen mensen deel uit de volgende zeven onderzoeken: Simons ZoeklichtExperienCes of people withH cOpy number variants (ECHO study), Intellectual Disability and Mental Health: Assessing Genomic Impact on Neurodevelopment, Hospital Neurodevelopmental CNV Cohort at Belgrade University Children's Hospital, International 22q11.2 Deletion Syndrome Brain Behavior Consortium, Center for Autism Research at Children's Hospital of Philadelphia en 16p11.2 European Consortium.
  • Er waren 82 deelnemers met een 16p11.2 deletie, 50 met een 16p11.2 duplicatie, 370 met een 22q11.2 deletie en 45 met een 22q11.2 duplicatie.
  • Ongeveer de helft van de deelnemers met een 16p11.2 deletie, 16p11.2 duplicatie en 22q11.2 duplicatie voldeed aan de klinische criteria voor de diagnose autisme. Deelnemers met een 22q11.2 duplicatie hadden het laagste percentage, met slechts 1 op de 5 die aan de criteria voldeed. De onderzoekers verklaarden dat de autismepercentages betrekking hadden op het aantal mensen dat in de kliniek werd gevonden met deze genetische aandoeningen, waarbij geen rekening werd gehouden met mensen die niet werden gevonden omdat ze geen symptomen van de genetische aandoening hadden.
  • Van de deelnemers die niet voldeden aan de klinische definitie van autisme, hadden de meesten met een 16p11.2 deletie of duplicatie problemen op ten minste één gebied van de autismemeting.
  • Deelnemers met een 16p11.2 duplicatie of 22q11.2 duplicatie hadden minder ernstige kenmerken van autisme dan mensen met autisme in de algemene bevolking. Deelnemers met een 16p11.2 duplicatie of 22q11.2 duplicatie hadden autisme kenmerken die vergelijkbaar waren met mensen met autisme in de algemene bevolking.
  • De onderzoekers verklaarden dat er een grote variabiliteit was tussen elk van de genetische aandoeningen. Bovendien waren er bij alle vier de genetische aandoeningen meer mannen dan vrouwen met de diagnose autisme. Show Less
Am J Psychiatry 178, 77-86 (2021)
Chawner et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2021

Analyse van loopsynchronie en evenwicht bij neurologische ontwikkelingsstoornissen met behulp van computervisietechnieken
  • Deze onderzoekers wilden kijken of video-opnames van lopende kinderen gebruikt konden worden om beweging bij mensen met genetische aandoeningen te bestuderen. Dit zou het veel gemakkelijker maken voor mensen om beoordeeld te worden, omdat ze niet naar een kliniek of laboratorium hoeven te gaan voor testen. Kinderen zouden zo ook in hun normale omgeving kunnen lopen. Show More
  • De onderzoekers bestudeerden 15 in Simons Searchlight geregistreerde kinderen met een 16p11.2 deletie of duplicatie en hun broers en zussen zonder de aandoening. De onderzoekers gebruikten computertechnologie om de twee groepen te vergelijken.
  • Kinderen zonder de genetische aandoening bleken een betere balans en loopsynchronie te hebben dan kinderen met een deletie of duplicatie. Loopsynchronie is belangrijk om te bestuderen omdat het nodig is voor functionele mobiliteit, het uitvoeren van dagelijkse levenstaken en verbeteringen in de kwaliteit van leven.
  • De onderzoekers suggereerden dat deze methode goedkoop is en ons in staat zou stellen om de motorische ontwikkeling beter te begrijpen, met name de motorische controle en de soepelheid van bewegingen, in het licht van omgevingsobstakels.Show Less
Medische informatica J 27, 14604582211055650 (2021)
Ardalan et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2021

Atlas van functionele connectiviteitsrelaties tussen zeldzame en veel voorkomende genetische varianten, eigenschappen en psychiatrische aandoeningen
  • Veel factoren kunnen leiden tot een psychiatrische aandoening, waaronder omgevingsfactoren en genetische factoren. Belangrijk is dat sommige mensen veel gemeenschappelijke genetische veranderingen hebben die kunnen bijdragen aan de ontwikkeling van een psychiatrische aandoening. Deze genetische veranderingen worden single nucleotide polymorfismen (SNPs) genoemd. Sommige mensen hebben zeldzame kopiegetalvarianten (CNV's). Een kopiegetalvariant (CNV) treedt op wanneer er een verandering is in een deel van het DNA waardoor een gen of meerdere genen verwijderd of gedupliceerd worden. Show More
  • Om de ontwikkeling van psychiatrische aandoeningen beter te begrijpen, bestudeerden de onderzoekers de verbanden tussen genetische risico's, eigenschappen en aandoeningen.
  • Deze studie omvatte deelnemers van vier onderzoeken of universiteiten: Simons Searchlight, University of California, Montreal rare genomic disorder family project, en define neuropsychiatric-CNVs project. De gegevens van Simons Searchlight omvatten deelnemers met 16p11.2 deleties, 16p11.2 duplicaties, 1q21.1 deleties en 1q21.1 duplicaties. De onderzoekers bestudeerden gegevens van 1.003 mensen met zeven verschillende CNVs die geassocieerd zijn met neuropsychiatrische aandoeningen en negen niet-psychiatrische CNVs. De studie omvatte ook meer dan 170 mensen zonder genetische aandoeningen en 778 mensen met autisme, schizofrenie, bipolaire stoornis of ADHD.
  • De onderzoekers gebruikten functionele magnetische resonantiebeeldvorming in rusttoestand (rs-fMRI) om te testen hoe hersengebieden met elkaar samenwerken. rs-fMRI volgt veranderingen in het zuurstofgehalte in het bloed als een maat voor hersenactiviteit in hersengebieden wanneer de persoon in rust is.
  • De onderzoekers ontdekten dat zowel veel voorkomende als zeldzame genetische risicofactoren voor psychiatrische aandoeningen invloed hadden op de meeste netwerken van hersenconnectiviteit.
  • De combinatie van verschillende genen had een grote invloed op de hersenconnectiviteit: grotere deleties of duplicaties van een deel van het DNA hadden een groter effect op het IQ en het risico op de aandoening, terwijl een aantal kleinere veranderingen, SNP's genaamd, kleinere effecten hadden.
  • Overlappingen in de functie van de hele hersenen waren licht tot matig bij genetische risico's, aandoeningen en eigenschappen. Functionele veranderingen die leidden tot deze overeenkomsten waren onder andere overconnectiviteit van de thalamus en somatomotorische netwerken. De thalamus regio van de hersenen is nodig om de zintuigen van het lichaam te verwerken (behalve geur), en het speelt een rol in slaap, waakzaamheid, bewustzijn, leren en geheugen. Het somatomotorische netwerk is het hersengebied dat nodig is voor motorische taken en coördinatie.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
medRxiv Voordruk, (2021)
Moreau et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
1q21.1 deletie
1q21.1 duplicatie
2021

Karakterisering van slaapproblemen bij 16p11.2 deletie en duplicatie
  • Slaapstoornissen komen vaak voor bij mensen met een neurologische ontwikkelingsstoornis, maar slaapproblemen bij mensen met 16p11.2 deleties of duplicaties zijn niet onderzocht.Show More
  • De onderzoekers bestudeerden de slaappatronen van 345 jongeren en 347 volwassenen die geregistreerd waren bij Simons Searchlight. Hieronder waren 136 mensen met een 16p11.2 deletie, 112 mensen met een 16p11.2 duplicatie en 444 mensen zonder genetische aandoening.
  • De meest voorkomende slaapproblemen voor een kind met een 16p11.2 deletie waren gillend wakker worden en uit bed komen. Kinderen met een 16p11.2 duplicatie hadden ook problemen met uit bed komen en moeite met in slaap vallen. Kinderen met een deletie of duplicatie hadden meer slaapstoornissen dan deelnemers zonder de genetische aandoening.
  • Volwassenen met een deletie of duplicatie hadden problemen met in slaap vallen of in slaap blijven. De onderzoekers vonden geen verschil in slaapstoornissen tussen mannen en vrouwen.
  • De onderzoekers ontdekten ook dat deelnemers die samenwoonden met een persoon met een 16p11.2 deletie of duplicatie meer slaapstoornissen hadden dan deelnemers zonder genetische aandoening. De onderzoekers suggereerden dat familieleden mogelijk meer slaapstoornissen hebben omdat hun dierbaren slaapproblemen hebben.Show Less
J Autisme en ontwikkelingsstoornis Epub vooruitlopend op druk, (2021)
Kamara et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2021