Publicaties

Herziene datum: Oktober 2024

Bedankt aan alle gezinnen voor hun deelname aan Simons Zoeklicht. Door jouw betrokkenheid willen we onderzoekers en genetici wereldwijd helpen bij het begrijpen van genetische aandoeningen die van invloed zijn op jou of je familie.

Het onderzoek dat is uitgevoerd met de gegevens van Simons Searchlight heeft geresulteerd in een groot aantal gepubliceerde artikelen. Deze papers ondergaan een peer-review proces, waarbij andere wetenschappers het onderzoek beoordelen en valideren voor publicatie in wetenschappelijke tijdschriften. Bovendien worden sommige bevindingen gedeeld via preprints, waardoor informatie snel kan worden verspreid onder de wetenschappelijke gemeenschap.

Veel van de publicaties dragen de naam “Simons Variation in Individuals Project” (SimonsVIP), wat de oorspronkelijke naam was van ons onderzoeksprogramma, dat nu bekend staat als Simons Searchlight.

De artikelen zijn chronologisch gerangschikt, van oud naar nieuw. Je kunt publicaties per specifieke genetische aandoening bekijken met behulp van de onderstaande categorieën.

Vanaf oktober 2024 heeft Simons Searchlight bijgedragen aan 108 publicaties en preprints, en we zullen nieuwe publicaties blijven samenvatten.

Voor de toegankelijkheid moedigt de Simons Foundation onderzoekers aan om hun publicaties open access te maken. Als je geen toegang kunt krijgen tot een tijdschriftartikel, raden we je aan contact op te nemen met de laatste auteur die op het artikel vermeld staat om een kopie aan te vragen.

Publicatieverwijzingstitels begrijpen:

-De titel van het artikel wordt gevolgd door publicatiegegevens, waaronder waar en wanneer het artikel is gepubliceerd.
– Als er meer dan drie auteurs zijn, gebruiken we “et al.” voor extra medewerkers.
– Tijdschriften worden aangeduid met steno-namen.

Disclaimer: Houd er rekening mee dat artikelen die op medRxiv (uitgesproken als med-archive) of bioRxiv (uitgesproken als bio-archive) worden geplaatst, niet door vakgenoten worden beoordeeld of geredigeerd voordat ze online worden gepubliceerd. Alle andere artikelen die hier worden genoemd, zijn daarentegen beoordeeld door collega-onderzoekers om de kwaliteit en nauwkeurigheid te garanderen. Hoewel het publiceren op medRxiv of bioRxiv onderzoekers in staat stelt om hun bevindingen snel te delen, kunnen de uiteindelijke gepubliceerde resultaten verschillen nadat ze formele peer review hebben ondergaan voor publicatie in een tijdschrift.

Show More
Show Less

Search

  • Filter
  • Clear All
Genetic Condition
Year of Publication
90 Publications
Gedetailleerd klinisch en psychologisch fenotype van de X-gebonden HNRNPH2-gerelateerde neurologische ontwikkelingsstoornis
  • Dit is de eerste publicatie over HNRNPH2 met Simons Searchlight-gegevens. HNRNPH2 staat voor heterogene nucleaire ribonucleoproteïne H2 en is belangrijk voor de celfunctie en helpt hersencellen om verbindingen te maken.Show More
  • De onderzoekers bestudeerden mensen met een genetische verandering in HNRNPH2. Met toestemming van de familie van de deelnemers werd hun informatie gedeeld met Simons Searchlight. Deze informatie werd gekoppeld aan informatie die al was verstrekt door mensen die deelnemen aan Simons Zoeklicht.
  • De onderzoekers bestudeerden 33 mensen met een pathogene, of waarschijnlijk pathogene, genetische verandering in HNRNPH2. Het artikel bevat een grote tabel met de medische kenmerken van de deelnemers en foto's van lachende deelnemers.
  • Bijna de helft van de deelnemers had ooit een aanval gehad. De meeste kinderen hadden hypotonie, moeite met coördineren en evenwichtsproblemen.
  • Als kinderen een MRI van de hersenen lieten maken, waren de meest voorkomende bevindingen een verandering in de bundel van hersencellen die de linker- en rechterkant van de hersenen verbindt, vertraagde ontwikkeling van de beschermende laag van hersencellen en een verminderde hersenomvang in het gebied dat de coördinatie en het evenwicht regelt.
  • De meeste kinderen maakten zich zorgen over hun voeding en maag en veel ouders zeiden dat hun kinderen chronische constipatie hadden.
  • Dit artikel bevat veel meer details over de medische bevindingen bij zowel mannen als vrouwen met genetische veranderingen in HNRNPH2.Show Less
Neurol Genet 7, e551 (2021)
Bain et al.
Full Article

HNRNPH2
2021

De algemene impact van haploinsufficiëntie op hersenconnectiviteit ligt ten grondslag aan het pleiotrope effect van neuropsychiatrische CNV's
  • De onderzoekers keken naar verschillende kopiegetalvarianten (CNV) om te bestuderen hoe de hersenen zich vormen wanneer iemand een CNV heeft. Een CNV ontstaat wanneer het aantal kopieën van een genregio is aangetast, een set genen is verwijderd of extra/duplicaat is in een regio van het DNA. 16p11.2 deletie is een voorbeeld van een CNV.Show More
  • De onderzoekers gebruikten MRI-scans (Magnetic Resonance Imaging) van mensen met 1q21.1 en 16p11.2 CNVs in Simons Searchlight. Ze namen ook mensen op met 15q11.2, 17q12 en 22q11.2 CNVs uit andere onderzoeken.
  • Bij alle onderzochte genetische aandoeningen vonden ze veranderingen in de hersenen in verschillende hersengebieden. Ze keken ook naar de kenmerken van IQ, autisme, schizofrenie en ADHD binnen de groepen en bekeken patronen in hersenconnectiviteit. Dit was de eerste keer dat MRI's werden onderzocht voor 1q21.1 en 15q11.2 CNVs.
  • De onderzoekers ontdekten dat een gebied in de hersenen genaamd de thalamus vaak aangetast was door deze CNVs. Veranderingen in de thalamus zijn gekoppeld aan neuropsychiatrische aandoeningen. De thalamus regio van de hersenen is nodig om de zintuigen van het lichaam te verwerken (behalve reuk), en het speelt een rol in slaap, waakzaamheid, bewustzijn, leren en geheugen.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Bio Psy 89, S40 (2021)
Moreau et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
1q21.1 deletie
1q21.1 duplicatie
2021

Corticale organoïden modelleren vroege hersenontwikkeling verstoord door 16p11.2 kopiegetal varianten in autisme
  • Deze onderzoekers maakten mini-hersenen om de celprocessen te bestuderen die beïnvloed worden door een 16p11.2 deletie of duplicatie.Show More
  • De onderzoekers gebruikten geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC's) om de minihersenen te maken. iPSC's zijn een speciaal soort cellen die in andere lichaamscellen kunnen worden veranderd, waardoor het makkelijker wordt om delen van het lichaam te bestuderen die moeilijk te bestuderen zijn, zoals hersencellen. De iPSC's waren afkomstig van deelnemers aan Simons Searchlight met een 16p11.2 deletie of duplicatie.
  • De onderzoekers ontdekten dat 16p11.2 deletie minihersenen groter waren en dat 16p11.2 duplicatie minihersenen kleiner waren. Dit is vergelijkbaar met wat er bij mensen is gevonden.
  • De onderzoekers bestudeerden de genetische expressie en het eiwitprofiel in deze minihersenen. Ze konden kleine verschillen zien wanneer de hersenen 'jonger' of eerder in ontwikkeling waren.
  • Ze vonden meer veranderingen in de hersenen wanneer de hersenen 'ouder' of later in ontwikkeling waren. Deze bevindingen suggereren dat problemen in de ontwikkeling van de hersenen later in de menselijke ontwikkeling of later in de zwangerschap meer beïnvloed zouden worden.
  • Vroeg in de ontwikkeling hadden deze hersenen problemen met celmigratie. In de baarmoeder heeft de zich ontwikkelende foetus hersencellen nodig om te migreren van de gebieden waar ze geboren worden naar de gebieden waar ze zich zullen vestigen voor de juiste hersenverbindingen. Deze migratie gebeurt al in de tweede maand van de zwangerschap.
  • De onderzoekers ontdekten dat genen die betrokken zijn bij hersencelfuncties en hersencelcommunicatie aangetast waren in de 16p11.2 mini-hersenen. Vergelijkbare resultaten werden gevonden in minihersenen van mensen met autisme en een andere genetische aandoening van Simons Searchlight die van invloed is op het CHD8-gen.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Mol Psychiatrie 26, 7560-7580 (2021)
Urresti et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2021

Spontane neurale activiteit houdt verband met psychiatrische kenmerken in 16p11.2 CNV-dragers: Een analyse van EEG spectraal vermogen en multischaal entropie
  • Deze onderzoekers bestudeerden elektro-encefalogrammen (EEG's) van deelnemers aan Simons Searchlight om meer te weten te komen over de hersenactiviteit in rust bij mensen met een 16p11.2 deletie of duplicatie. Een EEG meet de elektrische activiteit in de hersenen. Show More
  • De onderzoekers richtten zich op het voorste deel van de hersenen dat belangrijk is voor beweging, taal en vaardigheden die uitvoerende functies worden genoemd. Executieve functievaardigheden omvatten zelfcontrole, flexibel denken en werkgeheugen.
  • Dit onderzoek omvatte 25 mensen met een 16p11.2 deletie, 14 mensen met een 16p11.2 duplicatie en 14 mensen zonder deze genetische veranderingen.
  • Het artikel bevat een overzichtstabel van de verschillende veranderde hersenfuncties bij mensen met een 16p11.2 deletie of duplicatie uit andere gepubliceerde artikelen.
  • In de voorste regio van de hersenen vonden de onderzoekers een verhoogde hersendynamiek bij deelnemers met een 16p11.2 deletie of duplicatie. Deelnemers met een 16p11.2 duplicatie hadden hersenpatronen die geassocieerd worden met slaperigheid. Deelnemers met een 16p11.2 deletie hadden een verband tussen onregelmatige hersenpatronen en angstproblemen, evenals pervasieve ontwikkelingsproblemen.
  • De onderzoekers suggereerden dat abnormale frontale hersenactiviteit bepaalde psychiatrische kenmerken sterk lijkt te weerspiegelen.Show Less
J Psychiatr Res 136, 610-618 (2021)
Al-Jawahiri et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2021

Mutaties geassocieerd met neuropsychiatrische aandoeningen bakenen functionele dimensies van hersenconnectiviteit af die bijdragen aan autisme en schizofrenie
  • Deze onderzoekers gebruikten functionele magnetische resonantiebeeldvorming in rusttoestand (rs-fMRI) om te testen hoe hersengebieden met elkaar interageren. rs-fMRI volgt veranderingen in het zuurstofniveau in het bloed als een maat voor hersenactiviteit in hersengebieden wanneer de persoon in rust is.Show More
  • De onderzoekers wilden weten of er verschillen zijn in de patronen van hersenconnectiviteit bij mensen met kopiegetalvarianten (CNV's) en autisme, aanvallen of ADHD. Ze bestudeerden 101 mensen met een 16p11.2 of 22q11.2 deletie of duplicatie, 755 mensen met autisme, aanvallen of ADHD en 1.072 mensen zonder genetische aandoening. Simons Searchlight deelnemers met een 16p11.2 CNV werden opgenomen in deze studie.
  • De onderzoekers ontdekten dat de patronen van hersenconnectiviteit van deelnemers met een 16p11.2 of 22q11.2 deletie of duplicatie vergelijkbaar waren met de patronen van deelnemers met autisme en epileptische aanvallen, maar niet met de patronen van deelnemers met ADHD.
  • Deelnemers met een 16p11.2 of 22q11.2 deletie of duplicatie, autisme of epileptische aanvallen hadden een toename in hersenverbindingen in bepaalde hersengebieden. Deze toename vond plaats in een gebied dat zich tussen twee hersengebieden bevindt: het gebied dat belangrijk is voor slapen, waken, bewustzijn, leren en geheugen en de sensorische, motorische, auditieve en visuele netwerken.
  • Deze overeenkomsten in de hersenen tussen deelnemers met gen-deleties, gen-verdubbelingen en neurologische aandoeningen suggereren dat er een gemeenschappelijk pad zou kunnen zijn voor de ontwikkeling van deze aandoeningen.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Nat Commun 11, 5272 (2020)
Moreau et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2020

Genoomwijde moleculaire effecten van de neuropsychiatrische 16p11 CNVs in een iPSC-to-iN neuronaal model
  • Geestelijke aandoeningen, zoals schizofrenie of angst, kunnen erfelijk zijn en onderzoekers hebben geprobeerd te begrijpen welke factoren erfelijk kunnen zijn. Show More
  • De 16p11.2 deletie en duplicatie zijn in verband gebracht met neuropsychiatrische aandoeningen.
  • De onderzoekers gebruikten 16p11.2 deletie en duplicatie geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC's) van Simons Searchlight. iPSC's zijn een speciaal soort cellen die in andere lichaamscellen kunnen worden veranderd, waardoor het makkelijker wordt om delen van het lichaam te bestuderen die moeilijk te verkrijgen zijn, zoals hersencellen.
  • Deze iPSC's werden omgezet in verschillende hersencellen om te leren welk type genen aan of uit werden gezet die zouden kunnen leiden tot geestelijke gezondheidsproblemen.
  • De onderzoekers ontdekten dat genen in de regio 16p11.2 en daarbuiten werden beïnvloed in de in het lab gemaakte hersencellen. Ze gebruikten 16p11.2 deletie en duplicatie muismodellen om te zien of bij muizen dezelfde genen aan of uit staan.
  • De onderzoekers testten de genen met de grootste verandering in vismodellen om te zien of ze de ontwikkeling van de hersenen beïnvloedden. Ze suggereerden dat het PCSK9-gen, dat staat voor proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, van invloed zou kunnen zijn op de grootte van het hoofd, de ontwikkeling van de hersenen en de lichaamsomvang bij mensen met een 16p11.2 kopiegetalvariant.
  • De onderzoekers ontdekten ook dat er op het DNA buiten de 16p11.2 regio een verhoogde methylering was. Dit betekent dat het DNA gemarkeerd was om uitgeschakeld te worden.Show Less
bioRxiv Voordruk, (2020)
Afdeling et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2020

Evaluatie van heterogeniteit in ASS-symptomatologie, cognitief vermogen en adaptief functioneren bij 16p11.2 CNV-dragers
  • Om te bestuderen welke omgevingsfactoren zouden kunnen leiden tot de verschillen bij mensen met een 16p11.2 deletie of duplicatie, bestudeerden onderzoekers Simons Searchlight deelnemers. Ze keken naar prenatale en postnatale factoren die de medische symptomen van mensen zouden kunnen beïnvloeden. Sommige mensen met een 16p11.2 deletie krijgen bijvoorbeeld de diagnose autisme en anderen niet. Show More
  • De onderzoekers ontdekten dat er bij deelnemers met een 16p11.2 deletie een verhoogd aantal perinatale factoren was en dat genetische veranderingen buiten de 16p11.2 regio verband houden met autisme of sociale afwijkingen. Voorbeelden van perinatale factoren: in stuitligging, laag geboortegewicht, lage apgarscore en ademnood.
  • Bij deelnemers met een 16p11.2 duplicatie ontdekten de onderzoekers dat een verhoogd aantal genetische veranderingen buiten de 16p11.2 regio en het feit dat ze man zijn, verband hielden met een verhoogde kans op autisme.
  • De onderzoekers bestudeerden ook de effecten van omgevingsfactoren op verbaal IQ of non-verbaal IQ, repetitief gedrag en het vermogen om zich aan te passen aan verschillende situaties. Vrouw zijn verlaagde de autismesymptomatologie bij deelnemers met een deletie of duplicatie, maar had geen groot effect op het IQ.
  • De onderzoekers suggereren dat er meer moet worden gedaan om andere omgevingsfactoren te begrijpen.Show Less
Autisme 13, 1300-1310 (2020)
Hudac et al.
Full Article

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2020