Publicaties

Herziene datum: Oktober 2024

Bedankt aan alle gezinnen voor hun deelname aan Simons Zoeklicht. Door jouw betrokkenheid willen we onderzoekers en genetici wereldwijd helpen bij het begrijpen van genetische aandoeningen die van invloed zijn op jou of je familie.

Het onderzoek dat is uitgevoerd met de gegevens van Simons Searchlight heeft geresulteerd in een groot aantal gepubliceerde artikelen. Deze papers ondergaan een peer-review proces, waarbij andere wetenschappers het onderzoek beoordelen en valideren voor publicatie in wetenschappelijke tijdschriften. Bovendien worden sommige bevindingen gedeeld via preprints, waardoor informatie snel kan worden verspreid onder de wetenschappelijke gemeenschap.

Veel van de publicaties dragen de naam “Simons Variation in Individuals Project” (SimonsVIP), wat de oorspronkelijke naam was van ons onderzoeksprogramma, dat nu bekend staat als Simons Searchlight.

De artikelen zijn chronologisch gerangschikt, van oud naar nieuw. Je kunt publicaties per specifieke genetische aandoening bekijken met behulp van de onderstaande categorieën.

Vanaf oktober 2024 heeft Simons Searchlight bijgedragen aan 108 publicaties en preprints, en we zullen nieuwe publicaties blijven samenvatten.

Voor de toegankelijkheid moedigt de Simons Foundation onderzoekers aan om hun publicaties open access te maken. Als je geen toegang kunt krijgen tot een tijdschriftartikel, raden we je aan contact op te nemen met de laatste auteur die op het artikel vermeld staat om een kopie aan te vragen.

Publicatieverwijzingstitels begrijpen:

-De titel van het artikel wordt gevolgd door publicatiegegevens, waaronder waar en wanneer het artikel is gepubliceerd.
– Als er meer dan drie auteurs zijn, gebruiken we “et al.” voor extra medewerkers.
– Tijdschriften worden aangeduid met steno-namen.

Disclaimer: Houd er rekening mee dat artikelen die op medRxiv (uitgesproken als med-archive) of bioRxiv (uitgesproken als bio-archive) worden geplaatst, niet door vakgenoten worden beoordeeld of geredigeerd voordat ze online worden gepubliceerd. Alle andere artikelen die hier worden genoemd, zijn daarentegen beoordeeld door collega-onderzoekers om de kwaliteit en nauwkeurigheid te garanderen. Hoewel het publiceren op medRxiv of bioRxiv onderzoekers in staat stelt om hun bevindingen snel te delen, kunnen de uiteindelijke gepubliceerde resultaten verschillen nadat ze formele peer review hebben ondergaan voor publicatie in een tijdschrift.

Meer tonen
Minder tonen

Zoek op

  • Filter
  • Alles wissen
Genetische aandoening
Jaar van publicatie
90 Publicaties
De psychiatrische fenotypes van 1q21 distale deletie en duplicatie
  • Een kopiegetalvariant (CNV) treedt op wanneer er een verandering optreedt in een deel van het DNA waardoor een gen of meerdere genen verwijderd of gedupliceerd worden. 1q21 deletie is een voorbeeld van een CNV.Meer tonen
  • Onderzoekers bestudeerden het grootste aantal mensen tot nu toe met een 1q21 CNV. Hieronder waren 51 kinderen met een 1q21 deletie, 44 kinderen met een 1q21 duplicatie, 17 volwassenen met een 1q21 deletie en 11 volwassenen met een 1q21 duplicatie. Er werden 28 kinderen en 32 volwassenen geïncludeerd die geen genetische aandoening hadden.
  • Deelnemers met een 1q21 CNV werden geïncludeerd uit drie verschillende internationale, persoonlijke onderzoeken: Simons Searchlight, CNV Research Group van het Universitair Ziekenhuis Lausanne en Neuroscience and Mental Health Research Institute van de Universiteit van Cardiff.
  • Kinderen met een duplicatie of deletie hadden een grotere kans op neurologische ontwikkelingsstoornissen zoals autisme, ADHD en verstandelijke beperkingen dan kinderen zonder de genetische aandoening.
  • De onderzoekers ontdekten dat angst veel voorkwam bij deelnemers met een deletie of duplicatie.
  • Deelnemers met een 1q21 deletie hadden meestal een kleiner hoofd dan deelnemers met een 1q21 duplicatie.
  • De onderzoekers suggereerden dat kleinere studies van mensen met een 1q21 deletie of duplicatie geen accurate percentages gaven van bepaalde diagnoses op het gebied van geestelijke gezondheid. Ze ontdekten dat er geen bewijs was voor een verband met bepaalde psychiatrische syndromen, in tegenstelling tot wat er in andere publicaties is beschreven.
  • Het IQ van deelnemers met een 1q21 deletie of duplicatie varieerde sterk, maar het was meestal lager dan het IQ van deelnemers zonder de genetische aandoening. Dit gold voor iedereen behalve volwassenen met een 1q21 duplicatie.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Minder tonen
Psychiatrie 11, 105 (2018)
Linden et al.
Volledig artikel

1q21.1 deletie
1q21.1 duplicatie
2018

Vertragingspatronen bij het bereiken van mijlpalen in de vroege grove motoriek en expressieve taal bij proefpersonen met genetische aandoeningen versus idiopathische ASS uit SFARI-registers
  • Deze onderzoekers bestudeerden wanneer motorische en taalmijlpalen werden bereikt bij kinderen met genetische aandoeningen die geassocieerd worden met neurologische ontwikkelingsstoornissen, in vergelijking met mensen met autisme en mensen zonder genetische diagnose.Meer tonen
  • Motorische mijlpalen waren onder andere leren zitten, kruipen of lopen. Taalmijlpalen waren onder andere het ontwikkelen van losse woorden en combinaties van woorden.
  • Kinderen met autisme ontwikkelen motorische mijlpalen meestal binnen een typisch tijdsbestek, terwijl mensen met autisme hun taalmijlpalen binnen een gevarieerd tijdsbestek bereiken.
  • Dit is de eerste studie die een kruisvergelijking van meerdere genen bij Simons Searchlight-deelnemers heeft onderzocht.
  • De onderzoekers bestudeerden 16 genetische aandoeningen en gegevens in Simons Searchlight: 1q21.1 deletie, 1q21.1 duplicatie, 16p11.2 deletie, 16p11.2 duplicatie, ADNP, ASXL3, CSNK2A1, DYRK1A, GRIN2B, MED13L, PACS1, PPP2R5D, SCN2A, SLC6A1, STXBP1 en SYNGAP1. Aan dit onderzoek namen 479 deelnemers met een genetische diagnose deel.
  • De onderzoekers vergeleken de groep mensen met een genetische diagnose met 3.506 SPARK deelnemers die een genetische test ondergingen maar geen genetische diagnose hadden. Net als Simons Searchlight is ook SPARK een onderzoek dat wordt gefinancierd door de Simons Foundation. Mensen die deelnemen aan SPARK hebben een autismediagnose.
  • Van de groep mensen met een genetische diagnose had 1 op de 3 een autismediagnose, 1 op de 4 had een verstandelijke beperking en 1 op de 3 had epileptische aanvallen. Bij de groep mensen met autisme had 1 op de 10 een verstandelijke beperking en 1 op de 25 had aanvallen. Dit document bevat een tabel met elke genetische aandoening en de leeftijd waarop elke mijlpaal werd bereikt.
  • De groep met een genetische diagnose had meer vertraging bij het bereiken van hun motorische en taalmijlpalen dan deelnemers met autisme. Maar deelnemers met autisme hadden ook vertraagde taalmijlpalen.
  • Acht van de genetische aandoeningen (ADNP, ASXL3, GRIN2B, MED13L, PACS1, PPP2R5D, STXBP1 en SYNGAP1) hadden vertragingen voor alle mijlpalen bij ten minste de helft van de deelnemers.
  • De onderzoekers suggereerden dat motorische vertragingen van zes maanden of het nooit bereiken van de mijlpaal een indicator waren van een genetische aandoening, terwijl spraakvertragingen niet specifiek waren voor deze genetische aandoeningen.Minder tonen
Kinderpsychiatrie 62, 1297-1307 (2018)
Wickstrom et al.
Volledig artikel

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
1q21.1 deletie
1q21.1 duplicatie
ADNP
ASXL3
CSNK2A1
DYRK1A
GRIN2B
MED13L
PACS1
PPP2R5D
SCN2A
SLC6A1
STXBP1
SYNGAP1
2018

Focale corticale afwijkingen en taalstoornissen bij het 16p11.2 deletie- en duplicatiesyndroom
  • Om te kijken hoe dik het corticale gebied van de hersenen is bij mensen met een 16p11.2 deletie of duplicatie, deden onderzoekers MRI (Magnetic Resonance Imaging) bij Simons Searchlight deelnemers. Het corticale gebied van de hersenen is de buitenste laag zenuwcellen rondom de hersenen en bestaat uit verschillende lagen. Meer tonen
  • Mensen van 8 jaar en ouder werden geïncludeerd in deze grote beeldvormingsstudie: 43 mensen met een 16p11.2 deletie, 45 mensen met een 16p11.2 duplicatie, 2 mensen met een 16p11.2 triplicatie en 106 mensen zonder een deletie of duplicatie.
  • De onderzoekers ontdekten dat deelnemers met een 16p11.2 deletie of duplicatie variaties hadden in de dikte van hun corticale gebieden, en dit was niet uniform over de hele hersenen.
  • Deelnemers met 16p11.2 deleties hadden dikke corticale gebieden die belangrijk waren voor het begrijpen van taal, horen, verwerken van zicht en het voelen van aanrakingen. Deelnemers met 16p11.2 duplicaties hadden andere gebieden van de cortex die erg dik waren.
  • Beide patronen van corticale dikte van de hersenen kwamen overeen met de algemene hoofdomvangpatronen die gevonden werden bij mensen met deleties of duplicaties.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Minder tonen
Hersenschors 28, 2422-2430 (2018)
Blackmon et al.
Volledig artikel

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2018

Vooruitgang in het begrijpen en behandelen van SCN2A-gemedieerde aandoeningen
  • Dit is de eerste publicatie die zich richt op de SCN2A-gegevens van Simons Searchlight.Meer tonen
  • SCN2A staat voor Sodium channel protein type 2 subunit alpha. SCN2A is betrokken bij de activiteit van hersencellen.
  • Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) en Simons Searchlight organiseerden een bijeenkomst van experts op het gebied van SCN2A die samenkwamen om dit artikel te publiceren over wat er bekend is over SCN2A.
  • De onderzoekers beschreven welk type hersencellen SCN2A-functie nodig hebben bij mensen, en wat er is bestudeerd bij muizen.
  • Experts beschreven de drie soorten medische aandoeningen die kunnen optreden wanneer mensen een genetische verandering in SCN2A hebben. Ze suggereerden dat er in de VS elk jaar 400 baby's geboren zouden kunnen worden met een SCN2A-aandoening.
  • Afhankelijk van de SCN2A genetische verandering, kan de genetische aandoening het gevolg zijn van ofwel te veel SCN2A activiteit in de hersenen of te weinig SCN2A activiteit. Er is een goede balans tussen wat nodig is voor een goede hersenactiviteit.
  • Of iemand een SCN2A-variant heeft die te veel of te weinig activiteit veroorzaakt, moet bekend zijn voor toekomstige behandelingsopties. Er zijn nog geen behandelingsopties beschikbaar.
  • Aan het einde van de publicatie schetsten de onderzoekers de belangrijkste vragen die wetenschappers moeten beantwoorden om SCN2A-aandoeningen beter te begrijpen en behandelingen te ontwikkelen.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Minder tonen
Trends neurowetenschappen 41, 442-456 (2018)
Sanders et al.
Volledig artikel

SCN2A
2018

Mens-specifieke NOTCH2NL-genen beïnvloeden Notch-signalering en corticale neurogenese
  • Mensen met een 1q21.1 deletie hebben een kleinere hersenomvang dan gemiddeld en mensen met een 1q21.1 duplicatie hebben een grotere hersenomvang dan gemiddeld.Meer tonen
  • Onderzoekers bestudeerden het gedeelte van het menselijke DNA dat zich bevindt op 1q21.1 (dat wil zeggen de lange arm van chromosoom 1, regio 2, bandnummer 1, sub-band 1).
  • Bij mensen heeft de DNA-sectie 1q21.1 3 genen die betrokken zijn bij de ontwikkeling van de hersenen, genaamd NOTCH2-NLA, NOTCH2-NLB en NOTCH2-NLC.
  • NOTCH2 staat voor Neurogenic locus notch homolog protein 2. NLA, NLB en NLC staan voor N-terminal zoals A, B of C.
  • De onderzoekers suggereerden dat de NOTCH2-N-terminal achtige genen mensen hebben geholpen bij het ontwikkelen van een complexe hersenstructuur, maar deze genen zouden ook de reden kunnen zijn waarom er deleties of duplicaties zijn in het 1q21.1 DNA gedeelte.
  • Ze vergeleken de verschillen tussen de NOTCH2-N-terminal like genen A, B en C bij mensen en andere diersoorten.
  • Ze ontdekten dat de NOTCH2-N-terminal like genen met elkaar samenwerken om NOTCH2 activiteit te bevorderen.
  • Voor dit onderzoek werden huidcellen van zes Simons Searchlight 1q21.1 deelnemers onderzocht.Minder tonen
Cel 173, 1356-1369 (2018)
Fiddes et al.
Volledig artikel

1q21.1 deletie
1q21.1 duplicatie
2018

Kwantificering van de effecten van 16p11.2 kopiegetalvarianten op de hersenstructuur: Een multisite genetic-first studie
  • Eerdere studies beschreven de verschillen in hersenstructuur bij mensen met 16p11.2 deleties of duplicaties. Dit onderzoek richtte zich op het meten van het verschil als een kwantiteit.Meer tonen
  • Magnetic resonance imaging (MRI) werd uitgevoerd bij deelnemers aan Simons Searchlight en bij deelnemers aan 16p11.2 in een onderzoek in Europa. Het onderzoek omvatte 78 mensen met een 16p11.2 deletie, 71 mensen met een 16p11.2 duplicatie en 212 mensen zonder een deletie of duplicatie.
  • Deze publicatie bevatte de lijst met psychiatrische diagnoses voor elke groep mensen. Hieronder vallen autisme, ADHD en motorische stoornissen.
  • Deze studie vond soortgelijke hersenpatronen als andere MRI-studies. Hersengebieden aangetast door een 16p11.2 deletie of duplicatie waren betrokken bij taal, het maken van geluiden, werkgeheugen, flexibel denken en zelfcontrole. De diagnose van verschillende psychiatrische aandoeningen was niet gerelateerd aan specifieke hersenstructuren.
  • Dit onderzoek werd ondersteund door een subsidie van de Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Minder tonen
Biologische psychiatrie 84, 253-264 (2018)
Martin-Brevet et al.
Volledig artikel

16p11.2 deletie
16p11.2 duplicatie
2018

Haplotype-specifieke MAPK3 expressie in 16p11.2 deletie draagt bij aan variabele neurologische ontwikkeling
  • Deze onderzoekers bestudeerden klinische en genetische informatie van verschillende mensen om te leren welke genen binnen de 16p11.2 regio een belangrijke rol zouden kunnen spelen in de ontwikkeling.Meer tonen
  • Deze studie omvatte 31 kinderen met een 16p11.2 deletie en geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC's) van menselijke deelnemers. iPSC's zijn een speciaal soort cellen die in andere lichaamscellen kunnen worden veranderd, waardoor het makkelijker wordt om delen van het lichaam te bestuderen die moeilijk te bestuderen zijn, zoals hersencellen.
  • Deze studie omvatte ook een groep mensen uit China. Deze deelnemers hadden een 16p11.2 deletie. De onderzoekers vergeleken de bevindingen van deze groep met de gegevens van Simons Searchlight.
  • De onderzoekers creëerden een haplotype. Dit betekent dat ze het patroon van genen bestudeerden bij deelnemers met een 16p11.2 deletie en autisme, om te zien of ze genen konden vinden die mogelijk nodig zijn voor de hersenfunctie. Er zijn ongeveer 29 genen opgenomen in het typische 16p11.2 deletiegebied, maar niet elke persoon met de deletie mist dezelfde genen (zie onderstaande afbeelding). De breekpunten kunnen per persoon verschillen en meer of minder genen omvatten.
  • De onderzoekers veranderden de iPSC's in hersencellen en keken welke genen tot expressie kwamen. Het controleren op genexpressie is één manier om te weten of het gen door de cel wordt gebruikt. Verschillende celtypes brengen verschillende genen tot expressie.
  • De onderzoekers ontdekten dat het MAPK3-gen een belangrijke bijdrage leverde aan de ontwikkeling van hersencellen. MAPK3 staat voor mitogen-activated protein kinase 3 en is een enzym dat nodig is voor celcommunicatie.
  • Dit onderzoek richtte zich op de rol van MAPK3 in genexpressie en de ontwikkeling van menselijke hersencellen. De bevindingen suggereren dat medische kenmerken die veroorzaakt worden door een 16p11.2 deletie niet alleen te wijten zijn aan een MAPK3, maar ook aan andere genen in de regio.Minder tonen
Hersenen Epub vooruitlopend op druk, (2018)
Liu et al.
Volledig artikel

16p11.2 deletie
2018